通州清真寺乃北京地区四大清真寺之,郊区称首。其元代创建,历史之悠久,仅次于宣武区牛街者。明代正统,万历间予以重修。清康熙、乾隆帝游通州时曾经至此,再增修之。民国二十二年(1933)四月,一撮日军窜犯县城,隔运河炮轰通州城,炸毁此寺部分建筑,旋而修复。三十四年(1945),此寺曾办大学。寺前胡同曾因寺而名清真寺街,今名胡同。20世纪50年代,著名影片《野火春风斗古城》曾在此拍摄。1959年定为通州区文物保护单位,1966年后遭到破坏,1996年升定为北京市文物保护单位。
寺东向,跨南北二院。轴线上主体建筑礼拜殿尚存,勾连搭四卷,明三暗五,形制恢宏,顶式多样,集中国左建殿宇之大成,为城郊罕有。一、二卷均三间,前为敞厅,卷棚顶,后乃过厅,硬山脊;三、四卷皆五间,前为调大脊,后为歇山脊;四卷明间后为望月楼,四角攒尖脊带琉璃宝瓶。殿内设井口天花,写意牡丹图案;四周梁枋满饰重彩博古图。数十根金柱朱漆,皆围捏铁线缠枝牡丹,绚丽夺目,为独具特色。第二卷两山之侧,各建一座六角攒尖顶过门亭,各与第三卷稍间相通,此种设计亦属独到。主院北讲堂,水房尚存,碑记5块多嵌砌于壁。若胡同北口殿式木碑楼与主院内照壁、垂花门、室礼楼不在"文革"中破坏,则此寺可与牛街清真寺难分伯仲。